SMA Negeri 1 Magetan berdiri pada tanggal 1 Agustus 1961, pada saat itu merupakan filial dari SMA C Madiun (sekarang SMA Negeri 2 Madiun). Jumlah ruang 8 lokal dan Bapak Syahlan sebagai perintisnya. Dalam perjalanan waktu selama 5 dekade SMA Negeri 1 Magetan mengalami perkembangan seperti saat ini lengkap dengan kelebihan dan kekurangannya.
Kepala Sekolah yang pernah bertugas sebagai berikut :
- Syahlan (1961) Sebagai Pengelola
- R. Sayid (1961-1962) Sebagai PLH
- Drs. Achmadi Erri Sugianto (1962-1968)
- Sumarsono (1968-1972)
- Moehadi Reksodidjojo (1972-1981)
- Suparin, BA (1981-1984
- Hadi Suyatno, BA (1984-1986)
- Tirto, BA (1986-1989)
- R. Fx Suluh Sujudi, BA (1989-1992)
- Drs. Soetjarjo, M.Pd (1992-2000)
- Drs. Soetikno, MM (2000-2005)
- Drs. Supriyadi, MM (2005-2008)
- Drs. Moh Ichwan (2008-2010)
- Dra. Hj. Mahmudah, M.Pd (2010-Sekarang)